Actualmente, los módulos de que dispone Gesdatos son los siguientes:

1. Gestión de los datos de la organización:
   Permite la introducción y actualización de los datos de la organización.
2. Gestión de ficheros:
   Permite identificar y registrar los ficheros en la aplicación, así como modificarlos y darlos de baja.
3. Gestión de personal: usuarios y responsables
   Mediante ésta se pueden gestionar los diferentes elementos personales de la organización.
   Contempla diferentes niveles:
   1. Las figuras que contempla el RD 994/99:
        Responsable del fichero
        Responsables de seguridad
        Usuarios
   2. Otras que se presentan como opcionales, pero que la práctica ha demostrado son útiles:
        Gestores de fichero concreto
        Usuarios de atención
4. Gestión de incidencias LOPD
   Permite gestionar las incidencias de forma automatizada, pudiendo así:
   1. Registrar las incidencias
   2. Generar informe de incidencias
   3. Confeccionar y modificar el procedimiento de gestión y notificación de incidencias
5. Gestión de copias de seguridad
   Permite identificar el procedimiento de copias de seguridad aplicadas en el/los sistemas de información de la propia organización y/o por terceros prestadores del servicio, así como el procedimiento para la recuperación o restauración de datos.
6. Gestión de contraseñas
   Permite identificar el control de acceso lógico a nivel de red y aplicaciones del sistema, así como de los ficheros en tratamiento.
7. Gestión de soportes
   Permite el control e identificación de los dispositivos de almacenamiento empleados por la organización, sobre la localización de éstos y ficheros alojados.
8. Pruebas con datos reales
   Ofrece un mecanismo para llevar un control estricto de las pruebas con datos reales, recogiendo las medidas adoptadas sobre los ficheros tratados.
9. Ficheros temporales
   Permite identificar los ficheros temporales generados por la organización, y las medidas de seguridad adoptadas.
10. Controles periódicos
    Permite llevar un control automatizado sobre el cumplimiento de cada medida técnica y organizativa asignada a los Responsable/s.
11. Registro de accesos
    Permite realizar un control sobre los accesos efectuados a los ficheros con datos especialmente protegidos.
12. Gestión de tareas pendientes
    De forma automática la aplicación genera un registro de las tareas pendientes, derivadas de un control periódico no superado, de alguna incidencia sin resolver.
13. Registro de auditorias
    Permite llevar un registro de las auditorias, internas o externas, practicadas en la organización.
14. Generación del documento de seguridad
    La aplicación genera en formato PDF el Documento de Seguridad, donde están reflejadas todas las medidas técnicas y organizativas de la organización, según la información introducida en GESDATOS.
15. Generación de manuales de usuarios y responsables
    Genera el manual con las obligaciones y funciones relativas a:
    1. Usuarios
    2. Responsables de Seguridad
    3. Gestores de Ficheros Concretos

Dado que la herramienta se presenta en formato On Line, ello le permite una pronta actualización y que sus desarrolladores puedan implementar nuevos módulos. Así en estos momentos están en fase de desarrollo los siguientes módulos y/o funcionalidades:
  1. Ejercicio de derechos
  2. Formación
  3. Ficheros no automatizados

Gesdatos Multiorganización permite el cumplimiento de todas las obligaciones exigidas por el RD 994/99 y está indicado especialmente para grupos de empresas. Incorpora un panel de control respecto de todos los documentos de seguridad del grupo.